1R線於2001年1月24日開辦，為嶼巴首條由市區開往大嶼山的路線，當時紅磡碼頭開往昂坪，途經尖沙咀、旺角及塘福(若巴士有剩餘座位，將加停東涌市中心。)，只於星期日及公眾假期提供服務。2003年5月1日加經深水埗，並在長沙灣道增設車站。2015年4月20日改停東通(達東路)總站，以配合東涌市中心總站重建，2019年1月12日紅磡總站遷往紅磡(紅鸞道)。
1R線主要方便市民或遊客於假日由九龍市區直達大嶼山旅遊熱點，而無須於東涌轉車，同時紓緩來往東涌至昂坪的23線之客量，由於1R線只開出數班車，而且班次較為疏落，加上大多數市民或遊客早已習慣於東涌市中心轉車，因此整體客量只屬一般。隨著來往東涌至昂坪的360纜車於2016年投入服務，因乘搭纜車往返兩地之行車時間較為快捷，而且班次亦相當頻密，使1R線客量有所下跌，班次亦因而被削減。
值得一題，1R線雖為嶼巴路線，但自開辦以來，一直使用母公司冠忠遊覽車的車隊，直至2025年1月29日(大年初一)，嶼巴為慶祝是年度農曆新年，破天荒派出是年度「乙巳蛇年」生肖巴士(Man RC2低地台單層空調巴士)行走1R線之特別加班車，因此成為嶼巴首次派出自己車隊行走1R線，亦是自家專營巴士首次於九龍市區行走。
34線於1997年8月16日開辦，當時來往東涌市中心至石門甲，途經東涌舊碼頭。2006年2月6日來回程繞經逸東總站，2007年1月9日來回程不再繞經東涌舊碼頭。2015年4月20日東涌總站遷往東涌(達東路)，以配合東涌市中心總站重建。
34線提供石門甲及赤立角新村村民往返東涌市中心，以及東涌站接駁港鐵之服務，惟因沿線人口甚少，因此平日客量偏低，但每逢假日，會有大量郊遊人士經石門甲前往地塘仔及昂坪的登山徑，所以34線於該日子之客量會較多，甚至出現全車滿座的情況。
37線於1999年6月20日開辦，當時循環來往東涌站至東涌碼頭。2000年8月31日提升為每天全日服務，並來回程繞經東涌北，2001年8月31日總站迪東涌站延長至逸東。
37線開辦初期，主要方便逸東邨及東涌北一帶的私人屋苑居民往返東涌市中心及東涌站接駁港鐵之服務，但因班次疏落，故此客量持續偏低，直至海堤灣畔、藍天海岸及映灣園等私人屋苑相繼入伙，以及位於松逸街及東涌北的多間學校開課，37線客量開始有所增長，然而當來往東涌站至東涌北的37A線(第一代，已停辦)提升至每天全日服務後，使兩線的服務範圍重叠，以至客量被分薄，故此37A線於2004年4月4日併入37線，並改為來往逸東至映灣園，同年5月30日逸東總站遷往逸東邨三號停車場地下室內總站，以配合逸東(二)邨入伙。
除著東薈城擴展部份及諾富特東薈城酒店相繼落成，同時連接東涌市中心及東涌北的行人天橋亦相應啟用，使居民或學生能以步行方式直達東薈城及東涌站，而映灣園也有班次頻密的免費屋邨巴士往來東涌站，令到37線需求大減，除了平日上課日上下課時段外，其餘時間客量甚低，因此於2006年11月19日縮減至只於星期一至五上課日上下課時段提供服務，其他時段由城巴E21A線的雙向分段收費取代，但因應居民要求，於同年11月25日恢復星期六及假日早上服務。
北大嶼山醫院首期於2013年啟用，為了方便東涌居民往返該處，37線於同年9月20日再度提升至每天全日服務。2017年2月16日東涌北總站延長至迎東邨，並來回程加停迎東路「昇薈」，以配合迎東邨、私人屋苑昇薈及東環入伙。
不過，37線之服務範圍與37H線大幅度重叠，而迎東邨一帶居民較傾向選乘較快捷的37M線往返東涌站，導致37及37H線的客量持續欠佳，故此37線於2021年2月7日再度恢復只於平日上課日上課及下課(只限往迎東邨方向)時段行走，並來回程不再繞經東涌發展碼頭，其餘時段由37H線代替。
38線於2001年3月15日開辦，循環來往逸東至東涌站。2004年5月30日逸東總站遷入逸東邨三號停車場地下室內總站，以配合逸東(二)邨入伙。
38線主要提供逸東邨居民往返東涌市中心及東涌站接駁港鐵之服務，初時因受到服服範圍相約的城巴S52及龍運S64線競爭，而且當班時班次較為稀疏，因此客量甚低，然而隨著逸東邨陸續入伙，人口因而有所增長，38線亦因而加密班次，而且與港鐵、城巴及龍運北大嶼山對外路線提供八達通轉乘優惠，因此客量不斷上升，更成為嶼巴盈利最高的路線。
2013年北大嶼山醫院啟用，翌年提供24小時急症室服務，因此38線除了往返東涌市中心之客源外，更需肩負來往該醫院的服務，使重要性再提一次提高，客量亦進一步增長。
A35線於1998年7月6日開辦，當時來往梅窩碼頭至機場(地面運輸中心)，途經國泰城、東涌市中心、東涌道及嶼南道，以配合赤鱲角機場啟用，同年7月11日機場總站遷往一號客運大樓(暢達路)。2006年9月29日乘客登車時先付往東涌的車資，如欲前往機場各站，則須在下車時另付東涌市中心至機場段的車資，同年10月21日部份班次繞經梅窩舊墟及東涌市中心。2015年4月20日因應東涌市中心總站重建，來回程改經東涌(達東路)總站。
A35線主要方便大嶼山南部(梅窩、南山、貝澳、長沙及塘福)及東涌道(伯公坳及石門甲)沿線居民往來機場，然而因嶼南區人口密度較少，來往機場的需求甚低，而且梅窩至東涌之一段走線與3M線完全重叠，而東涌至機場的服務亦有城巴及龍運聯營的S1、城巴S56及龍運64線提供，故此A35線客量一直偏低，因此於2008年11月16日起，大幅削減班次至每日兩邊方向開出五班車。2018年10月24日配合港珠澳大橋通車，當日早上九時起延長總站至港珠澳大橋香港口岸。2019年4月27日因應東涌市中心總站重建完成，來回程恢復繞經該處，2023年12月17日來回程繞經航天城總站。
值得一提，A35線創下多個「唯一」的紀錄，1.嶼巴唯一往返機場的路線；2.唯一於假日收取較高車費的日間機場路線；3.唯一設有雙向分段收費的機場路線；4.唯一沒有低地台巴士行走的機場路線；5.唯一不停機場客運大樓離境大堂層及機場(地面運輸中心)的「A」線；6.唯一只於繁忙時間提供服務的「A」線；7.與城巴A23及龍運A33X線，為僅有三條服務航天城的「A」線。
S1線於1999年6月20日開辦，由城巴及龍運營辦，為全港首條非過海全日聯營線，循環來往東涌至機場，途經民航處總部，以取代同日停辦的城巴S51及龍運S61線。2005年12月20日往東涌站方向繞經航天城路、航展道及航天城東路，以配合亞洲國際博覽館啟用。
S1線提供東涌居民往返機場客運大樓及機場東商業區之服務，由於路途相當快捷，而且亦唯一全日途經機場東商業區的路線，加上乘搭港鐵東涌綫轉乘S1線之車費，較機場巴士線(A線)及機場快綫便宜，因此有部份海外出版的旅遊指南及地圖也建議使用這個方式往來機票及市區，所以S1線無論任何時候每班車都高朋滿座，即使受到服務範圍相約的城巴S56線競爭，惟該線往機場須繞經東涌北，以及班次較為稀疏，故此對於S1線之影響甚低。
S52線於1998年6月22日開辦，當時來往東涌站至飛機維修區，途經國泰城及機場後勤區，以配合機場後勤區啟用。1999年6月20日配合S51線停辦，來回程改經駿裕路及駿運南路往返飛機燃料庫及機場空運中心，以經駿坪路，不經國泰城及機場空運貨站，同時因應S54停辦，增設與S55線(已停辦)之八達通轉乘優惠。2001年4月2日配合S55線停辦，原有八達通轉乘優惠改由E21線提供，同年4月23日東涌總站延長至逸東。2004年5月30日逸東總站遷往逸東邨三號停車場地下室內總站，2008年7月7日來回程恢復途經國泰城，不再途經駿裕路及駿運南路。
S52線主要方便於機場後勤區工作的東涌居民，然而因該處人流稀少，而且有不少機構設有員工巴士接載員工出入，加上部份走線與E21及龍運S64線重叠，以至客量長期偏低，只限繁忙時間及午膳時間才有較多乘客，而每逢假日，會有大量攝影愛好者及釣魚人士前往機場07R跑道末端的南環路旁邊攝影及垂釣，故此於該日也有一定的客量。
S56線於2002年12月7日開辦，當時來往東涌新發展碼頭至機場(一號客運大樓)，途經飛機燃料庫。2004年4月26日往機場方向繞經東涌北，同時東涌北前往機場之乘客，需於東涌新發展碼頭下車，然後使用同一張八達通免費轉乘下一班往機場方向的班次。2006年12月17日配合嶼巴37線縮減服務，非繁忙時間班次改以東涌站為總站，2007年12月10日往機場方向加停國泰城。2008年7月7日因應屯門至東涌渡輪航線停航，所有班次均以東涌站為總站，並取消東涌新發展碼頭之分站，同時由機場前往東涌北的乘客，到達東涌站後可於車上等候開往東涌北。2009年2月23日配合S56A線停辦，每日早上及傍晚部分班次加停東涌新發展碼頭。2016年8月22日所有班次均停靠東涌新發展碼頭，同時每日00:00由東涌站開出的尾班車以迎禧路昇薈對面為總站，不會前往機場。2017年2月27日往機場方向繞經迎東路，同時往返東涌站及機場的尾班車返回東涌站後，改以迎東路「昇薈」南行站為總站，同年7月18日每日00:00開出之尾班車改為先經東涌北，再繞經機場及東涌站，然後折返東涌北，並假留於「迎禧路」站結束行程的安排。2023年11月26日往機場方向繞經裕雅苑，往東涌方向繞經新落成的航天城總站，同時每日23:35及00:00由東涌站開出之班次繞經機場及東涌站後，改以怡東路「裕雅商場」站為總站。
S56與城巴及龍運營辦的S1線之兩邊總站相同，惟往機場方向繞經東涌北，故此主要客源為東涌北居民，但由於機場前往東涌的行車路線較S1線快捷，所以也吸納東涌市中心居民選乘，因此該方向之客量甚高，更經常出現全車滿載的情況。
S64線於1998年6月22日開辦，當時來往東涌站至赤鱲角碼頭，途經機場後勤區及客運大樓，以配合機場後勤區啟用。1999年6月20日配合S61線停辦，改為循環線運作，並往東涌方向不經地面運輸中心。
在新機場開幕初期，大量前往該處參觀，令S64線客量急劇大增，但當熱潮後，加上服務範圍亦與多條機場路線大幅度重叠，以至客量一直欠佳，直至2001年4月1日延長東涌總站至逸東後，客量才有所起色，2004年5月30日逸東總站遷入逸東邨三號停車場地下室內總站。
不過，S64線於機場內所覆蓋的範圍甚廣，以至走線迂迴，以及行車時間頗長，在居民及區議員不斷爭取下，於2014年11月22日延遲頭班車開出時間為09:08(平日)/08:15(假日)，而原有早上繁忙時間開往國泰城及機場後勤區，與及直接曞往國泰城、航膳東路及客運大樓之服務由同日開辦的新線S64C及S64X線取代。
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