B1 天慈 - 落馬洲站
落馬洲支線管制站及深圳福田口岸為繼羅湖口岸後，第二個鐵路接駁口岸，原先政府的規劃，是在九廣東鐵(現港鐵東鐵綫)落馬洲站及相連的深圳福田口岸啟用後，只容許鐵路的乘客使用過境，但經多名立法會議員大力爭取下，政府終於作出讓步，容許鐵路以外的公共交通工具的乘客使用落馬洲站過境，並於2006年6月公開招標落馬洲站往來元朗站的巴士路線，結果由九巴投得，編號為B1，原定於2007年7月起投入服務，但因深圳福田口岸要到同年7月31日才得到中央政府通過驗收，因此B1線通車日期一拖再拖，最後於同年8月2日的粵港合作聯席會議第十次會議上，時任行政長官宣佈，落馬洲支線、落馬洲站及福田口岸定於同年8月15日啟用，B1線隨即於當日1600起投入服務，當時往來元朗至落馬洲站。B1線投入服務初期，因收費昂貴及班次疏落，而且受到服務範圍相近的專綫小巴75線競爭，加上於落馬洲路不設車站，以致客量一直偏低，除著口岸啟用後客量急劇上升，使落馬洲路沿線候車的乘客經常無法登車，B1線因而逐步於落馬洲路增設車站，為該帶村民提供另一往來元朗市中心及落馬洲站的公共交通服務選擇，亦方便過境上學的學童轉乘校巴往來，以及發揮支援及疏導專綫小巴75線的作用，而B1線取道新田公路及元朗公路往返，並提供多條九巴及龍運巴士的八達通轉乘優惠，方便乘客轉駁往來市區、新界及機場，令到客量日漸增長。
天水圍居民一直要求有直達巴士往來落馬洲支線管制站，方便過境深圳福田口岸，九巴及運輸署於2008年的元朗區巴士路線發展計劃中，建議B1線延長至天水圍站，但由於原有計劃在天水圍區只停靠天水圍站，引致天水圍區居民及區議員相當不滿，經過一輪角力，運輸署終於作出讓步，修改天水圍區行車路線，由天水圍站開出後便繞經天耀、天盛苑、賞湖居及天慈，計劃獲得元朗區議會通過後，於2008年6月22日起實施，同時往落馬洲站方向改經青山公路(東行)、元朗站及博愛交匯處返回新田公路，而回程駛至博愛交匯處後，改經青山公路(西行)及朗天路前往天水圍站，以取代同日起因客量稀少而停辦的277線，並增設多項八達通轉乘優惠，方便天水圍居民，客量亦因而不斷上升，無論任何時候，每班車都滿載乘客，猶其是假日或長假期的日子，乘車人流更大幅倍增，即時增加班次，也經常出現供不應求的情況。2014年9月17日起配合天水圍總站(橋發街)興建居屋工程影響(現為屏欣苑)而永久封閉，總站遷往天水圍站總站。
九巴與運輸署於2014年的元朗區區域性巴士路線重組(2014年的元朗區巴士路線發展計劃)中，建議B1線總站遷往天慈，與276線的互調總站，並修改天水圍區內行車路線，令天水圍其他地區居民更易轉乘B1線，同年6月的修訂建議，則修改為276P線遷往天水圍站，276線仍以天慈作總站，但改經天湖路及天耀路，建議獲元朗區議會通過後，於同年11月22日起實施，同日起B1線總站遷往天慈，來回程取道天湖路、天耀路及天福路後返回原有路線，同時加密班次，日間部份往落馬洲站方向的班次，會改在媽橫路(山水樓)開出，以舒緩中途乘客的登車困難問題，並提供269M、276A及276B線的八達通轉乘優惠，以補差價或免費轉乘模式互轉B1線，方便天水圍北居民往返落馬洲支線管制站過境深圳福田口岸。2015年7月25日起，B1線往落馬洲站方向，試驗性於0900-1500時段班次加停新田公共運輸交匯處對面(巴士站位於青山公路新田段東行線)，試驗期經多次延長後，最終於2017年6月3日起擴展至所有班次均停靠，並改為永久措施，令B1線實際上完全繼承已停辦的277線(朗屏至落馬洲)的角色。
由於B1線未能覆蓋天水圍中部及北部，該等居民需乘搭其他交通工具前往天水圍南轉車，地區人士不斷要求九巴開辦天水圍北至落馬洲站的服務，經過一輪地區人士與運輸署的角力，九巴於2018年8月向運輸署提出建議，於假日早上至傍晚，開辦往返天水圍北至落馬洲站的特別班次，以天恩為總站，途經天恆、濕地公園路、美湖居及景湖居往返天慈巴士總站，再依常規班次走線往返落馬洲站，建議最終獲得落實，於2018年12月30日起實施，令該等地區居民可以一程車直達落馬洲站過境深圳福田口岸。2020年2月4日凌晨零時起落馬洲管制站因應新型冠狀病毒肺炎疫情而關閉，B1線隨即於當日起暫停服務，直至內地當局宣佈，於2023年1月8日解除入境強制隔離，中港正式恢復通關，B1線才恢復原有時段服務，但由天恩開出、繞經天水圍北之特別班仍然暫停服務，直至2025年12月13日起才恢復，改為天慈開往落馬洲站，繞經嘉湖北、天水圍北、天瑞及天水圍站，並改經元朗公路直達新田公路，不經元朗市。
值得一提，B1投入服務時，全程正價收費為$11.00，為吸引乘客使用B1線及與專綫小巴75線競爭，開辦當日實施優惠收費$10.00，其後九巴於2008年6月22日起加價，正價收費調整至$12.00，但優惠收費卻沒有跟隨調整，隨後九巴於2011年5月15日再次加價，全程優惠收費調整至$10.40，同年9月1日起全程收費再調整至$11.00，直至2012年1月1日起全程收費正式收回原價$12.00(現為$13.20)，不足八個月內調整收費三次，為專營巴士路線少有的紀錄。2013年1月1日起優惠分段收費正式恢復正價$10.90(現為$12.00)，至此B1線全程及分段收費均恢復正價。
B2線於2007年7月1日傍晚1800起投入服務，為同年初公開招標兩條往來深圳灣口岸的專營巴士路線之一(另一條為城巴B3線)，來往元朗站至深圳灣口岸，途經元朗大馬路、天慈、天耀及天瑞，以配合深圳灣口岸啟用及深港西部通道通車，而初時往元朗方向的收費方式較為特別，上車時先支付深圳灣口岸往天水圍的分段收費，然後在元朗區下車時才需補付往元朗及天水圍的車費差額，直至同年7月21日起所有由深圳灣口岸開出班次改為下車付款。
由於深圳灣口岸遠離深圳福田及羅湖等人流較多的地區，因此B2線於平日的客量並不高，但於星期六及假日為港人北上高峰期，客量大幅急增，大多數由元朗開出的巴士未到天水圍已全車滿座，為紓緩天水圍區中途站乘客的壓力，嶼巴於2008年7月26日起增辦B2P線，逢星期六及假日提供往來天水圍至深圳灣口岸，同日起B2線於該日子不經天水圍。2009年1月10日起逢星期六及假日來回程改經屏山至藍地一段的青山公路，不入天水圍區，以配合B2P線於同日起不再服務該處，同年7月13日起所有班次均改經青山公路(元朗至藍地段)，以配合B2P線於同日起提升為每天全日服務，與B2P線全面分拆，分流元朗及天水圍往來深圳灣口岸過境的乘客，由深圳灣口岸開出班次亦再次更改收費方式，上車時先支付深圳灣口岸往洪水橋的分段收費，然後在元朗區下車時才補付往元朗及洪水橋的車費差額。2020年4月3日起縮減服務時間，以配合深圳灣口岸因新型肺炎疫情而縮短服務時間，直至於2023年1月8日起恢復原有服務時段。
值得一提，B2線為嶼巴首條兩邊總站均在大嶼山以外的專營巴士路線及首條營辦的元朗區巴士路線，亦是首批總站位於深圳市內的香港專營巴士路線之一另外兩條為城巴B3及B3X線)，也是首條非九巴及龍運巴士營辦的元朗區巴士路線，同時為嶼巴首次開辦總站位於深圳市內的巴士路線，但實際上深圳灣口岸本身屬「一地兩檢」，深圳灣公路大橋及深圳灣口岸港方口岸區均實行香港特別行政區法律，因此嶼巴並沒有將B2線列為過境路線。此外，B2線投入服務初期，往深圳灣方向，沿途只准上車，不准下車，而往元朗方向，則沿途只准下車，不准上車，是自輕鐵專區於1993年6月1日起放寬後，再有新界西北路線實施這個安排，直至2014年8月24日起，往元朗方向於藍地以後巴士站均可上落，並增設分段收費。
2007年7月1日深圳灣口岸啟用，B2線隨即於同日傍晚1800起投入服務，提供元朗市及天水圍(天慈、天耀及天瑞)往來該口岸之服務，但該線於天水圍區未有覆蓋翠湖居，以及洪水橋及藍地，居民必須轉車才可前往，同時B2線於星期六及假日的客量相當高企，每班巴士離開元朗市後，都已滿載乘客，令到天水圍居民無法登車。
在多名元朗區議會、地區人士及當區居民的不斷爭取下，運輸署終於批准嶼巴由B2線分拆出一條B2P線，於2008年7月26日起投入服務，當時來往天水圍市中心至深圳灣口岸，途經天瑞、洪水橋及藍地，只於星期六及假日提供服務。2009年1月10日起天水圍總站遷往天慈，並來回程改經天水圍西交匯處至港深西部公路一段的元朗公路，不經洪水橋及藍地，該帶服務由B2線於同日起改經該處替代，同年7月13日起提升至每天全日服務，與B2線分流天水圍、元朗及青山公路(屏山至藍地)往來深圳灣口岸過境的乘客。2020年4月3日起縮減服務時間，以配合深圳灣口岸因新型肺炎疫情而縮短服務時間，直至於2023年1月8日起恢復原有服務時段。
由於深圳灣口岸遠離深圳福田及羅湖等人流較多的地區，所以B2P線於平日客量只屬一般，但於星期六、星期日及公眾假期為港人北上高峰期，因此於該日子的客量會倍增。
值得一提，B2P線為嶼巴第二條兩邊總站均在大嶼山以外的專營巴士路線及第二條營辦的元朗區巴士路線(首條為B2線)，亦是元朗區第二條全日服務的P線(首條為九巴276P線)，也是嶼巴唯一一條全日提供服務的P線，同時為嶼巴首次開辦總站位於深圳市內的巴士路線，但實際上深圳灣口岸本身屬「一地兩檢」，深圳灣公路大橋及深圳灣口岸港方口岸區均實行香港特別行政區法律，因此嶼巴並沒有將B2線列為過境路線。此外，B2P線投入服務初期，往深圳灣方向，沿途只准上車，不准下車，而往天水圍方向，則沿途只准下車，不准上車，是自輕鐵專區於1993年6月1日起放寬後，再有新界西北路線實施這個安排，直至2014年10月11日起，往天水圍方向於天水圍區內均可上落，並增設分段收費。
早於2007年深圳灣口岸啟用時，嶼巴部份車隊的電子路線牌資料庫中已存有B2X線的資料，但一直未被正式批准營辦，只曾於同年7月8日當天提供服務，之後嶼巴為舒緩過境高峰期間，往來天水圍至深圳灣口岸的乘客需求，B2P線於星期六及假日日間，都會加設非官方的短途班次，往返天水圍站至深圳灣口岸，後來嶼巴決定將此項特別短途班次正規化，並以天耀作總站，編號為B2X，經運，只於星期六、日及公眾假期提供服務。
B2X線提供天耀邨居民，以及天水圍站鐵路轉乘客於星期六或假日往來深圳灣口岸，行車路線與B2P線大致相同，主要疏導該線於假日的乘車人流。2020年2月8日起因應新冠肺炎疫情而暫停服務，直至現今仍未恢復服務。
值得一提，B2X線投入服務初期，往深圳灣方向，沿途只准上車，不准下車，而往天水圍方向，則沿途只准下車，不准上車，是自輕鐵專區於1993年6月1日起放寬後，再有新界西北路線實施這個安排，直至2014年10月11日起，往天水圍方向於天水圍區內均可上落，並增設分段收費。
B3線於2007年7月1日傍晚1800起投入服務，為同年初公開招標兩條往來深圳灣口岸的專營巴士路線之一(另一條為嶼巴B2線)，在招標時，原本計劃屯門區總站為屯門碼頭，並繞經山景、大興、建生及兆康苑，但被屯門區議員指路線過份繞路，結果在B3線開辦當天，分拆出往返屯門市中心至深圳灣口岸的特快線B3X線，以作輔助服務。
由於B3線幾乎行走整個屯門區，以致在該區的走線相當迂迴，因此客量一直欠佳，同時該線未有覆蓋良田及富泰一帶，在多名屯門區議會不斷爭取下，運輸署終於批准城巴開辦B3A線，於2008年8月16日起投入服務，來往山景至深圳灣口岸，途經大興、良田、寶田、兆康苑及富泰，而B3線則於同日起駛經屯門鄉事會路後，取道杯渡路、屯門公路及元朗公路直接往來深圳灣口岸，同年11月17日起，在B3X線於深圳灣口岸開出尾車後之班次，加停屯門公路虹橋巴士站。2020年4月3日起縮減服務時間，以配合深圳灣口岸因新型肺炎疫情而縮短服務時間，直至於2023年4月1日起恢復原有服務時段。
值得一提，B3線為城巴首批兩邊總站均在港島區或北大嶼山/機場以外的專營巴士路線之一(另一條為同日投入服務的B3X線)，以及首批總站位於深圳市內的香港專營巴士路線之一，亦是城巴自2001年撤出中港直通巴士市場六年來，再次有巴士路線駛進深圳市範圍，但深圳灣口岸本身屬「一地兩檢」，深圳灣公路大橋及深圳灣口岸港方口岸區均實行香港特別行政區法律，因此城巴並沒有將B3線列為過境路線。
B3線投入服務之初，幾乎行走整個屯門區，以致在該區的走線相當迂迴，因此客量一直欠佳，同時該線未有覆蓋良田、兆康苑及富泰一帶，在多名屯門區議會不斷爭取下，運輸署終於批准城巴開辦B3A線，於2008年8月16日起投入服務，成為屯門區第三條直達過境口岸的專營巴士路線，總站設於山景(鳴琴輕鐵站旁)，途經大興、良田、寶田、建生、兆康苑及富泰，以取代B3線於山景至兆康苑一帶的服務，同時標誌城巴站牌首次於屯門西北區及富泰邨出現。
及後B3A線的山景總站於2012年10月15日起遷往山景邨(景樂樓)對出，回程改經石排頭路，同時來回程加停青麟路近五柳路巴士站，更方便山景、大興、兆康苑及藍地居民，由於山景邨(景樂樓)總站設於屋邨範圍內的限制道路，巴士由石排頭路入邨以及於鳴琴路離邨時皆需通過停車場閘口，而閘口更亭無人當值，車長需以筷子或長形膠片按動對講機，要求停車場職員遙距開啟閘口供巴士通過，因此B3線也成為城巴唯一一條總站位於公共屋邨邨內限制道路內的專營巴士路線。
B3A線提供屯門西北區居民往來深圳灣口岸，客量自投入服務以來，一直不斷上升，猶其星期六及假日為港人北上高峰期，客量更大幅倍增。2020年4月3日起縮減服務時間，以配合深圳灣口岸因新型肺炎疫情而縮短服務時間，直至於2023年4月1日起恢復原有服務時段。
在屯門西北的屯門54區，於2022年起先後落成公共屋邨「菁田邨」及「和田邨」，及私人屋苑「NOVO LAND」，加上特區政府決定於菁田邨以北與建簡約公屋（預計2025年初落成），導致該區人口不斷上升，從而增加該區交通需求，同時新冠肺炎防疫措施正式解除，中港恢復全面通關，通勤過境及周末假日往返內地的市民不斷增加，故此為配合不斷增加的過境交通需求，城巴於2024年的巴士路線計劃內，建議B3A線來回程改經興貴街、欣寶路及紫田路，為屯門54區居民提供直達深圳灣口岸的巴士服務，建議獲屯門區議會通過後，於2024年7月28日起實施，而原有寶怡花園及屯門醫院往返深圳灣口岸的服務，則由修改走線後的56及56A線提供轉乘優惠替代，同時該兩線於同日起提升服務。
值得一提，B3A線的深圳灣口岸總站(港方管轄區)，位於深圳市，因此B3A線實際上是過境巴士路線，但深圳灣口岸本身屬「一地兩檢」，深圳灣公路大橋及深圳灣口岸港方口岸區均實行香港特別行政區法律，因此城巴並沒有將B3A線列為過境路線。
2007年7月1日深圳灣口岸啟用，城巴隨即於同日起開辦B3及B3X線提供屯門市中心往來深圳灣口岸的巴士服務，但由於B3X線由屯門市中心開出後，取道屯門公路、元朗公路及深港西部通道直達深圳灣口岸，走線非常直接，因此客量亦自投入服務以來一直不斷上升，在假日經常出現無不應求的情況。
隨著中港過境乘客對B3X線的需求日漸殷切，而屯門市中心總站已無法容納大量乘客，加上該線於總站開出時經已滿載乘客甚至頂閘，以致新墟居民久候多時仍未能登車。鑑於屯門站總站尚有空間，適逢港鐵屯門站上蓋物業「瓏門」基座的大型商場V City於2013年落成開幕，城巴因而建議開辦新路線B3M，以分流B3X線的乘客，最終B3M線2013年7月21日起投入服務，循環來往深圳灣口岸至屯門市中心，途經新墟。
B3M線主要提供屯門站一帶居民往來深圳灣口岸，亦同時疏導B3X線於屯門市中心及新墟的乘車人流。2020年4月3日起縮減服務時間，以配合深圳灣口岸因新型肺炎疫情而縮短服務時間，但隨著疫情漸退，中港亦恢復通關，惟B3M線仍未恢復服務，直至2024年12月28日起配合深圳地鐵13號線通車，才恢復行駛，惟只於星期六、日及公眾假期提供服務。
值得一提，B3M線的深圳灣口岸總站(港方管轄區)，位於深圳市，因此B3M線實際上是過境巴士路線，但深圳灣口岸本身屬「一地兩檢」，深圳灣公路大橋及深圳灣口岸港方口岸區均實行香港特別行政區法律，因此城巴並沒有將B3M線列為過境路線。此外，B3M線全程行車里數為31.8公里，曾一度成為全港最長的日間循環專營巴士路線，但該項紀錄於2017年1月23日，被當日起延長路線後的九巴88X線以38.9公里打破。
因應深圳灣口岸即將啟用，運輸署於2007年初公開招標兩條往來深圳灣口岸至屯門及元朗的專營巴士路線，而其中往返屯門的路線由城巴投得經營權，在招標時，原本計劃屯門區總站為屯門碼頭，並繞經山景、大興、建生及兆康苑，但被屯門區議員指路線過份繞路，結果在B3線開辦當天，分拆出往返屯門市中心至深圳灣口岸的特快線B3X線，以輔助B3線服務，最終B3X線於於2007年7月1日深圳灣口岸啟用當日傍晚1800起投入服務。2008年8月16日起往深圳灣口岸方向增停屯門公路「新墟街市」及「紅橋」站，往屯門市中心方向則增停屯門公路「紅橋」及屯興路「屯門官立中學」站。
B3X線由屯門市中心開出後，直接取道屯門公路(初時不停新墟及紅橋)、元朗公路及深港西部通道直達深圳灣口岸，走線非常直接，因此自投入服務以來，客量一直相當龐大，猶其星期六及假日為港人北上高峰期，客量更大幅倍增，即使增加班次，也經常出現供不應求的情況，及後為疏導乘車人流，城巴於2013年7月21日開辦B3M線，往來屯門站至深圳灣口岸，以分流B3X線的乘客。2020年4月3日起縮減服務時間，以配合深圳灣口岸因新型肺炎疫情而縮短服務時間，直至於2023年1月8日起恢復原有服務時段。
值得一提，B3X線為城巴首批兩邊總站均在港島區或北大嶼山/機場以外的專營巴士路線之一(另一條為B3線)，以及首批總站位於深圳市內的香港專營巴士路線之一，亦一度是首條及唯一一條來回程中途不停站的日間專營巴士路線，後為方便更多屯門區居民及區外轉乘客轉乘，於2008年8月16日起去程加停屯門公路(新墟及紅橋)，回程則加停屯門公路近紅橋及屯興路巴士站。此外，B3X線的深圳灣口岸總站(港方管轄區)，位於深圳市，因此B3M線實際上是過境巴士路線，但深圳灣口岸本身屬「一地兩檢」，深圳灣公路大橋及深圳灣口岸港方口岸區均實行香港特別行政區法律，因此城巴並沒有將B3X線列為過境路線，同時B3X線之屯門市中心總站設於屯門鄉事會路近輕鐵市中心站，與九巴及龍運路線屯門市中心總站(位於B3X線總站對面)有所不同。
B4線於2018年10月24日早上0900起投入服務，為運輸署於2016年發表的港珠澳大橋香港口岸的本地公共交通服務安排內的建議開辦的兩條專營巴士路線之一(另外一條為城巴B5線)，循環來往港珠澳大橋香港口岸至機場(客運大樓)，途經航天城，提供24小時服務，以配合港珠澳大橋香港口岸啟用。
B4線主要方便由澳門或珠海經港珠澳大橋前往香港過境的旅客或市民往返機場(客運大樓)及航天城，惟由於各區已有13條「A」線機場巴士路線繞經港珠澳大橋香港口岸，其他路線也有提供八達通轉乘優惠，加上來往澳門至香港國際機場直達穿梭巴士於2019年12月起開辦，部份本地航空公司亦有為乘搭該公司航班的珠海及澳門居民，提供包車服務往返香港機場及珠海/澳門口岸，因此自投入服務以來，客量長期偏低，經常出現「吉車遊街」之情況。2020年4月3日起縮減服務時間，以配合港珠澳大橋香港口岸因新型肺炎疫情而縮短服務時間，並暫停通宵時段服務，同年4月20日起更全線暫停服務，直至於2023年1月8日起恢復原有服務時段。
機場管理局於2018年12月宣佈，將於機場海天碼頭以東興建多式聯運中轉客運大樓，並興建全長約570米的封閉行車橋，連接香港國際機場限制區與港珠澳大橋香港口岸人工島，該客運大樓落成後，當日往返澳門邊檢大樓至香港多式聯運大樓的專線巴士正式投入服務，取道港珠澳大橋珠海及澳門口岸出境的旅客，可乘搭專用封閉式巴士，經港珠澳大橋直達香港國際機場禁區範圍内的多式聯運大樓，再經機場内的旅客捷運系統，到達登機閘口轉飛海外，期間無需辦理香港出入境手續，上述工程已於2019年1月25日展開，於2023年8月30日正式啟用，自此B4線已失去了大橋香港口岸接駁機場轉乘飛機離境的作用，客量亦進一步下跌，同年11月26日起繞經航天城總站(屬2023年的巴士路線計劃之建議選項)。
值得一提，B4線是繼A35及N35線後，嶼巴第三條服務機場島的專營巴士路線，亦與B6線為香港首兩條提供24小時服務的專營路線，而且深宵時段並無收取較高票價。
B5線於2018年10月24日早上0900起投入服務，為運輸署於2016年發表的港珠澳大橋香港口岸的本地公共交通服務安排內的建議開辦的兩條專營巴士路線之一(另外一條為嶼巴B4線)，來往港珠澳大橋香港口岸至欣澳站，途經北大嶼山快速公路，部份班次繞經迪士尼樂園，已配合港珠澳大橋香港口岸啟用。
B5線主要方便由澳門或珠海經港珠澳大橋前往香港過境的旅客或市民往來欣澳站轉乘港鐵東涌綫，以及迪士尼樂園遊玩，因此自投入服務以來，客量一直維持高水平，猶其是星期六或假日，來往迪士尼樂園之客源會大幅倍增，城巴更需增加班次疏導乘客，及後因應嶼巴B6線自港珠澳大橋香港通車後，乘客不斷增多，客量更超出負荷，因此時任運輸及房屋局(現改組為運輸及物流局)局長建議乘客改乘B5線到欣澳站接駁港鐵，有不少旅行團響應呼籲，使B5線得以分流B6線的龐大客流，加上港鐵一度增設與B5線轉乘優惠(直至2024年5月6日起結束)，利用此方法往返大橋香港口岸眾多，亦為B5線帶來不少乘客，在出入境高峰期，於欣澳站及港珠澳大橋香港口岸公共運輸交匯處，經常出現市民及旅客大排長龍等候B5線的情況。
因應新型肺炎疫情影響，B5線於2020年4月3日起縮減服務時間，更一度只提供早上由欣澳站開出之班次，直至2023年1月8日起恢復原有服務時段，同年4月29日起改為只於香港迪士尼樂園早上入場的繁忙時段(往欣澳站方向)及晚上煙花表演結束後的時段(往港珠澳大橋香港口岸方向)，才繞經迪士尼樂園公共運輸交匯處(屬2020年的巴士路線計劃之建議項目)。
值得一提，B5線投入服務後，成為首條以欣澳站作總站的專營巴士路線(愉景灣巴士DB03R及DB03P線，屬非專營巴士路線)，也是現時整個大嶼山島上收費最便宜的跨區全日路線及往返迪士尼樂園最便宜的公共交通工具(全程收費$6.10)，同時B5線的總站欣澳站及途經的迪士尼樂園公共運輸交匯處，雖然位於大嶼山島上，但按現時區議會選舉選區分界，屬荃灣區議會範圍，因此B5線屬跨區路線，亦成為唯一一條被歸類為大嶼山北部對外巴士路線而非北大嶼山巴士路線，也是首條及唯一一條服務範圍完全在大嶼山島內的大嶼山北部對外巴士路線及首條非R字頭開首的香港迪士尼樂園度假區專營巴士路線。
因應港珠澳大橋香港口岸即將啟用，運輸署於2016年發表的港珠澳大橋香港口岸的本地公共交通服務安排，建議在港珠澳大橋通車當日增闢一條往返東涌站的專綫小巴路線，但有地區人士認為，署方原本建議香港口岸至東涌站專綫小巴路線，既不足以完全應付鐵路轉乘的客量，車廂亦沒有足夠空間存放行李，經考慮各方面意見後，署方遂決定改辦專營巴士取而代之，總站設在滿東邨，以期服務更多東涌居民，同時另開辦一條專綫小巴路線(現專綫小巴901線)往返東涌北，途經機場航膳區，其後往來香港口岸至滿東邨的專營巴士路線，由嶼巴投得經營權，編號定為B6，於2018年10月24日早上0900起投入服務，途經東涌市中心，提供24小時服務，以配合港珠澳大橋香港口岸啟用，亦成為滿東邨於同年10月落成後，首條以該處作總站的巴士路線。
滿東邨於2018年11月全面入伙後，往返該處至東涌市中心的39M線客量不斷上升，甚至達到飽和程度，有離島區議員收到不少當區居民投訴登車困難，隨後向離島區議會提出議案，要求B6線增設分段收費及善用在東涌市中心至東涌西的剩餘運載力，減輕39M線的負荷，最終議案獲得接納，B6線於2019年9月23日起增設東涌市中心至滿東邨的單向分段收費，同時正式改經原建議的走線，取道北大嶼山公路及順朗路往返東涌及港珠澳大橋香港口岸，不經機場後勤區(觀景路及東岸路)。因應新型肺炎疫情影響，B6線由2020年2月8日起縮減服務時間，並暫停通宵時段服務，直至2023年1月8日起恢復原有時段服務。
B6線主要方便東涌居民及港鐵東涌綫轉乘客往來港珠澳大橋香港口岸，轉乘過境穿梭巴士往返澳門或珠海，與同樣接駁港珠澳大橋香港口岸至欣澳站的城巴B5線互相競爭，由於港珠澳大橋距離東涌市中心最近，加上東涌市中心已有「東薈城名店倉」可供旅客購物，亦可轉乘其他巴士路線前往大嶼山南或往返市區的E線，因此B6線自投入服務首天，已經有大批乘客在港珠澳大橋香港口岸及東涌站等候，猶其周末及假日不少內地及澳門的「一日旅行團」均會安排團友乘搭B6線往來東涌市中心至香港口岸，令東涌站巴士站出現大排長龍的情況，因此時任運輸及房屋局(現改組為運輸及物流局)局長建議乘客改乘B5線到欣澳站接駁港鐵，有不少旅行團響應呼籲，使B6的客量得以紓緩。
鑑於B6線往港珠澳大橋香港口岸方向，由東涌西一帶巴士站上車要支付全費，加上主要的客源在港鐵東涌站及東涌市中心一帶，以致資源未能充份運用，而39M線於平日早上繁忙時間，於滿東邨經常出現大排長龍候車的情況。在東涌地區人士及區議員爭取下，運輸署於2024年10月向離島區議會提交諮詢文件，建議B6線於星期一至五早上0700-0830時段前往港珠澳大橋香港口岸方向，駛至達東路(北行)後，改為繞經東涌站總站而不經東涌(達東路)總站，然後經達東路(南行)返回順東路(東行)原有路線，駛往港珠澳大橋香港口岸，並獲獨立編號為B6S，並設有滿東邨至東涌站的短程分段收費，方便滿東邨及逸東邨居民有另一便宜選擇前往東涌站轉乘港鐵，同時舒緩39M線同時段的負荷，建議最終獲得落實，於同年11月25日起實施。
值得一提，B6與B4線為香港首兩條24小時服務的專營路線，而且深宵時段並無收取較高票價。
B7線於2023年2月6日起投入服務，為公開招標三條往來香園圍口岸的專營巴士路線之一(另外兩條為城巴B8及九巴B9線)，來往上水(寶運路)至香園圍口岸，途經天平、粉嶺站及香園圍公路，以配合香園圍口岸啟用。
過往北區居民大多數乘搭港鐵東鐵綫經羅湖口岸或落馬洲站(福田口岸)往來內地，惟由粉嶺站或上水站乘搭東鐵前往羅湖或落馬洲站之收費較為昂貴，因此當B7線投入服務後，為北區居民提供便宜的過境交通服務，乘搭東鐵綫轉乘B7線過境，比起直接乘搭東鐵綫經羅湖及落馬洲站過境便宜得多，因此乘客反應相當熱烈，投入服務首天，城巴已自行加密班次，其後更於上課日早上及下午、星期六及假日往來過境人流的高峰時段自行加密班次行走，惟仍然經常出現供不應求之情況。
值得一提，B7線途經的香園圍公路(龍山隧道近龍山至粉嶺公路交匯處一段)屬大埔區，故此B7線成為繼九巴78線後，第二條需取道其他行政區前往的北區區內巴士路線，而B7線亦是繼56、56A、78X、79X、679及979線後，再次出現城巴獨營的北區專營巴士路線，而途經粉嶺站一帶的更只有B7線一條，更是寶運路一帶(上水鄉及對面的商貿區)首條及現時唯一一條專營巴士路線。此外，B7線與B8及九巴79K線，為三條提供每天全日往返香園圍口岸的專營巴士路線。
B8線於2023年2月11日起投入服務，為公開招標三條往來香園圍口岸的專營巴士路線之一(另外兩條為城巴B7及九巴B9線)，來往大圍站至香園圍口岸，途經秦石、乙明、富豪花園、濱景花園、大埔、太和(只限去程)及香園圍公路，當時只於星期六、日及公眾假期提供服務，以配合香園圍口岸啟用。
一直以來，大多數沙田及大埔居民都是乘搭港鐵東鐵綫經羅湖口岸或落馬洲站(福田口岸)前往內地，惟乘搭東鐵綫前往羅湖或落馬洲站之收費相當昂，故此當B8線投入服務後，為沙田及大埔區居民提供便宜的過境交通服務，加上B8線開辦首天及翌日，香園圍口岸停車場出現爆滿的情況，當局呼籲取道香園圍口岸過境的旅客改乘公共交通工具往來，導致B8線客量急劇上升，超出當局預期的客量水平，城巴因而將B8線自行加班至30分鐘一班，最終該項措施更獲恆常化，於2023年2月18日起正式實施，成為少數開辦後短時間便作出服務改動的專營巴士路線之一。
鑑於乘客反應理想，此城巴於2023年3月初正式向運輸署申請B8線提升至每天全日服務，並於同年4月份清明節及復活節長假期期間，試行提供平日早上至傍晚服務，同年8月21日起再度試行平日黃昏至晚上回程服務，因應乘客反應理想，於同年9月1日起除延續平日黃昏至晚上回程服務外，更以試辦形式增設平日早上至中午去程服務，因反應理想，於同年10月7日起正式常規實施，並增設大埔（翠怡花園）往大圍站的分段收費，以善用巴士在大埔區落客後的剩餘運載力。在地區人士多年爭取下，B8線於2025年9月22日起，星期一至五頭尾車時間終於獲得擴展至全日服務，與周末及假日看齊。
值得一提，B8線雖然屬於北區跨區對外巴士路線，實際上於北區只服務香園圍口岸，並未停靠北區其他地區，而B8線是繼56、56A、78X、79X、679、979及B7線後，再次出現城巴獨營的北區專營巴士路線，亦是城巴首條服務沙田及大埔區的非過海專營巴士路線，也令城巴站牌首次在大埔區及沙田區(大涌橋路)出現，開創城巴服務先河。此外，B8線與B7及九巴79K線，為三條提供每天全日往返香園圍口岸的專營巴士路線。
B9線於2023年2月11日起投入服務，為公開招標三條往來香園圍口岸的專營巴士路線之一(另外兩條為城巴B7及B8線)，來往屯門站至香園圍口岸，途經元朗公路、元朗站、新田公路、粉嶺公路及香園圍公路，當時只於星期六、日及公眾假期提供服務，以配合香園圍口岸啟用。
由於新界西北區(屯門、天水圍及元朗)已有多條巴士及專綫小巴線往返多個陸路口岸，而香園圍口岸距離該地區甚遠，不及深圳灣口岸或落馬洲站(福田口岸)，因此B9線客量只屬一般，惟長假期日子會有較多乘客選乘，九巴亦會於該段日子是乎情況增加班次。2023年4月因應清明節及復活節長假期期間過境需求增加，B9線於4月1日至10日期間的平日，試行提供服務，其後因應署假期間往來內地需求上升，B9線於同年8月1日起亦試行增設星期一至五服務，隨著取道香園圍管制站過關人次上升所帶來的客量需求，該項安排於同年9月2日起正式常規實施，同日起，九巴會視乎乘客需求，增設形點I/II往返香園圍口岸的短程班次。
值得一提，B9線為三條取道香園圍公路往返香園圍口岸的招標專營巴士路線中，唯一由九巴營運，以及行車里數最長，中途站數目最少的過境路線。
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自新冠肺炎疫情漸退，港人北上消費熱潮再次重現，密程度亦有增無減，令往返各過境口岸的公共交通需求持續上升，因此九巴於2024年5月勞動節「五一黃金周」起的三個周末及周日(5月4、5、11、12、5、18及19日)，以試辦形式開辦來往元朗(西)至香園圍口岸的巴士服務，編號為B9A，途經新田公路、粉嶺公路及香園圍公路，於早上及黃昏至晚上分別提供前往香園圍口岸及元朗方向的單向服務，並輔助B9線，其後四度延長試辦期至2026年6月30日，隨後於同年的巴士路計劃中，B9A線獲提升為常規服務，並於同年7月1日起開始實行。
B9A線主要方便元朗大馬路一帶居民往來香園圍口岸，同時輔助B9線，然而投入服務初期，客量並不高，直上港人北上消費日漸上升，客量才有明顯增長，猶其下午往元朗方向班次乘客較多。
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