54線前身為1933年6月10日開辦的第一代15線，當時來往元朗至錦田，途經凹頭，1941年12月10日起因日軍佔領香港而停駛。1948年1月1日起恢復服務，同時總站由錦田延長至橫台山，並改更編號為19(第一代)。1954年6月1日起總站由元朗延長至青山，1958年8月16日起總站由橫台山延長至上村，並調高全程收費。1962年1月12日起青山總站延長至青山灣，1967年7月25日起總站由青山灣大幅縮短至元朗。1968年1月起更改編號為18A(第二代)，1973年7月16日起配合九巴路線大規模重整，路線編號改為54。1979年11月1日起元朗總站遷往元朗(西)，2001年2月18日起提升為全空調服務。2012年3月31日起改為循環線運作，並以「八鄉古廟」站為循環點，不入上村總站，同年4月22日起恢復以上村總站為循環點。
54線開辦時，為鄉村人口充裕的年代，主要方便沿線村民往返元朗墟購物，以及擺買農作物，因此客量相當不俗，但當元朗墟於1980年代初發展成新市鎮，令到部份鄉村村民搬遷至市區，以致鄉村人口大幅下降，而且受到服務範圍相約的64K、77K，與及公共紅色小巴競爭，導致54線客量不斷下跌，班次亦被削減。
值得一提，1988年9月18日起輕鐵正式投入服務，一週後實施輕鐵專區，所有屯門及元朗區內巴士線改由輕鐵及其接駁巴士取代，雖然錦田及八鄉一帶屬元朗區範圍，惟遠離元朗市中心，所以該地區並未劃入輕鐵專區，因此54線成為輕鐵專區實施後，唯一仍然由九巴營運的元朗區內路線，直至第二代B1線於2007年8月15日起投入服務，才結束這個局面。
鑑於68F線於十八鄉一帶客量長期偏低，同時因應私人屋苑「峻巒」陸續有居民遷入，使該處往來元朗站的需求大幅上升，因此運輸署與九巴於2018年3月向元朗區議會建議削減68F線班次，並增設循環往來峻巒至元朗站之短程特別班次，與常規班次以聯合班次形式行走，最終建議獲得通過，並於2018年11月19日起實施，路線編號為68(第二代)，循環來往峻巒至形點ll，途經凹頭。
68線主要提供峻巒居民，以及沙埔村及凹頭沿線鄉村村民往來元朗站轉乘港鐵或其他巴士路線，惟因服務範圍人口密度較低，而且居民大多為有車階級，加上班次並不頻密，因此整體客量只屬一般。
68F線於2015年11月30日起以試辦形式投入服務，當時由元朗公園開往凹頭，途經十八鄉及元朗(東)，只於星期一至五早上繁忙時間開出兩班車，主要方便元朗南一帶豪宅區居民前往元朗站接駁港鐵屯馬綫或其他巴士路線，惟因服務時間有限，而且沿線居民大多數為有車階級，較少乘搭公共交通工具，以致客量一直甚低。
鑑於68F線客量欠佳，因此運輸署與九巴於2016年元朗區議會會議上，建議68F線提升至每天全日服務，並於10:00以後的班次改以循環線運作，同時往凹頭方向繞經博愛醫院，與及來回程繞經元朗站及加停鳳翔路，最終相關建議得到落實，於同年5月14日起實施。
除著位於凹頭的公共屋邨朗善邨，以及位於沙埔村的私人屋苑「峻巒 Park YOHO」首期於2016年中落成入伙，為方便該地區居民往來元朗站接駁港鐵屯馬綫或轉乘其他巴士路線，因此運輸署與九巴於《2016-2017年度元朗區巴士路線計劃》中，建議68F線改為循環來往元朗公園至峻巒，同時所有班次均繞經博愛醫院及行走全程循環線，其後建議獲得落實，並於2016年11月1日起實施。
不過，由於十八鄉路沿線發展仍未成熟，而且不少屋苑設有居民巴士往來元朗市，故此除繁忙時間外，其餘時間客量甚低，猶其元朗市至十八鄉路沿線經常出現「吉車遊街」之情況，及後為改善68F線於十八鄉一帶的客量，運輸署曾削減多條服務範圍相約的居民巴士線，以及拒絕該等居民巴士服務新申請，令到元朗區議會及地區人士強烈不滿，最終使當局劃一審批標準，批准兩個屋苑(譽88及溱柏)的居民巴士服務的新申請。
鑑於68F線客量持續偏低，同時因應私人屋苑「峻巒」陸續有居民遷入，使往返該處至元朗站的需求大幅上升，因此運輸署與九巴於2018年3月向元朗區議會提出，建議削減68F線班次，並增次循環往返峻巒至元朗站的短程特別班次，與常規班次提供聯合班次，期後短程特別班次之建議獲得元朗區議會通過，並獲獨立編號為68(第二代)，於2018手11月19日起實施，同日68F線改為循環來往峻巒至元朗公園。
自68F線延長至峻巒後，為方便該屋苑居民於港鐵元朗站接駁港鐵屯馬綫及輕鐵，來回程均途經朗日路(形點II)及朗樂路，為減少走線迂迴及節省行車時間，運輸署與九巴於《2022-2023年度巴士路線計劃》內，建議往元朗公園方向駛青山公路(西行)近形點I後，隨即直接左轉鳳翔路返口原有路線，不經朗日路及朗樂路，以提供更快捷的巴士服務直達鳳翔路、十八鄉路及元朗公園一帶屋苑，該建議隨後獲得元朗區議會通過，並於2022年12月19日起實施。
值得一提，68F線為輕鐵專區的區外路線上落限制於1993年6月1日起撤消後，以及輕鐵專區法例有關專營巴士不能開辦區內服務限制於2006年10月31日起屆滿後，九巴首條開辦總站及目的地均位於原有輕鐵專區範圍的路線。
因應元朗東頭工業區，以及天水圍北的發展，運輸署於《2021-2022年度巴士路線計劃》中，建議增闢一條循環來往天水圍(濕地公園路)至元朗(德業街)的路線，並以公開招標形式決定營辦商，由於當時只得城巴入標競投，故此該路線由城巴獲得經營權，惟該公司以疫情嚴重及欠缺需求為由而放棄營辦，其後當局再次公開招標，結果由九巴投得，於2022年12月18日起投入服務，路線編號為69(第二代)，來往天水圍市中心至元朗(德業街)，途經天水圍北、香港濕地公園、元朗廣場及朗屏站。
69線與港鐵巴士K73線之服務範圍相約，惟兩者於天水圍北之走線採取相反方向，69線直接取道濕地公園路及天慈路前往朗天路，無需K73線般繞經嘉湖北及天慈，因此行車時間較為快捷，亦方便前往元朗東頭工業區上班的天水圍居民，故此有一定乘客支持。
鑑於69線除了平日早上繁忙時間外，其餘時間客量甚低，因此為了改善資源，以及方便天水圍及元朗同心村居民往來元朗大馬路一帶，故此運輸署與九巴於《2025-2026年度巴士路線計劃》中，建議69線來回程改經擊壤路以東一段的青山公路(元朗大馬路)，其後建議獲得元朗區議會通過，於2025年8月11日起實施。
值得一提，69線為九巴首條，以及唯一一條往返天水圍至元朗的區內路線，其後於2024年7月4日起全線由女車長駕駛(車務調動除外)，因此69線成為九巴，以至全港唯一全以女車長駕駛的專營路線。
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早期，251M線為八鄉及上村唯一接駁大欖隧道轉車站的路線，惟該線於2003年12月14日起配合九廣西鐵(現港鐵屯馬綫屯門站至南昌站)即將通車，改為來往錦上路站至青衣站，使行車時間有所延長，令部份客量流失至九廣西鐵。
有見及此，九巴於《2009-2010年度元朗區巴士路線發展計劃》中，建議開辦兩條循環線(即251A及251B線)，以順逆時針方向繞經錦田、八鄉、上村及錦上路，以取代251M線，經過九巴與沿線區議會相討，251M線獲得保留，但縮短總站至上村，而251A線則定為循環往來錦上站至大欖隧道轉車站，途經錦上路及八鄉，最終建議獲得元朗區議會通過，並於2012年3月31日起實施。
251A線投入服務後，大部份客源是前往大欖隧道轉車站的乘客，惟來回程需繞經石湖塘一段的錦上路、東匯路及錦河路(港鐵八鄉車廠)，未能為錦上路一帶的居民提供便捷的九巴大欖隧道路線及港鐵屯馬綫接駁服務，猶其早上繁忙時間時段，錦上路西段更經常出現登車困難之情況。有見及此，運輸署與九巴於《2014-2015年度元朗區巴士路線發展計劃》內，建議修改251A線的走線，總站改在錦上路站，在駛經錦上路西段(東匯路至元崗村)後繞經八鄉路及大欖隧道轉車站，然後沿八鄉路返回錦上路東段(元崗村至上村)原有路線，隨後建議獲得元朗區議會通過，於2014年10月4日起實施。
值得一題，251A線開辦後，成為首條參與大欖隧道八達通轉乘優惠，但不在大欖隧道設站的路線，同時曾為九巴全日日間路線中，最遲開出尾班車，以及服務時間最長的九巴路線，這項紀錄直至2016年6月4日起被當日投入服務的新線213M打破。
鑑於來往八鄉及上村至青衣站的251M線客量長期欠佳，因此九巴於《2009-2010年度元朗區巴士路線發展計劃》中，建議增僻兩條循環線(即251A及251B線)，以順逆時針方向繞經錦田、八鄉、上村及錦上路，以取代251M線，經過九巴與沿線區議會相討，251M線獲得保留，但縮短總站至上村，而原有往返大欖隧道轉車站之服務由251A線取代，而開辦251B線之計劃因而被擱置。
不過，251M線更改服務後，客量依然偏低，故此開辦251B線之計劃再次於2014年的《2014-2015年度元朗區巴士路線發展計劃》中提出，是次的建議改為循環來往八鄉路(大欖隧道轉車站)至上村，取道錦河路及錦田公路往返，同時251M線則縮減為只於星期一至五早上提供三班單向開往荃灣站的服務，最終該建議獲得元朗區議會通過，並於2014年10月4日起投入服務。
251B線提供錦田、八鄉及上村沿線村民以快捷途徑往來大欖隧道轉車站轉乘其他路線前往各區，故此於繁忙時間客量非常不俗，惟其餘時間客量只屬一般。
香港政府於2020年推出「支援非政府機構過渡性房屋項目的資助計劃」，恆基兆業地產有限公司以象徵式一元租金，借出一幅位於元朗江夏圍的土地，為期七年，用作興建過渡性房屋，該項目名為「博愛江夏圍村」。
為配合博愛江夏圍村入伙，使該處人口有所增長，運輸署與九巴於《2021-2022年度巴士路線計劃》中，建議251A線增設繁忙時間特別班次往返博愛江夏圍村至錦上路站及八鄉路(大欖隧道轉車站)，於星期一至五早晚繁忙時間各提供兩班單向服務，方便居民接駁港鐵或於大欖隧道轉車站轉乘其他路線，該建議隨後獲得元朗區議會通過，並於2022年6月13日起實施，由於與251A線常規班次走線有所不同，因此獲路線編號為251C。
隨著博愛江夏圍村全面入伙，同時有鄰近的村民投訴無論任何時候，於江夏圍村對出的「八鄉新馬路」巴士站經常出現登車困難之情況，因此有當區區議員提出251C線提升至全日服務，最終在運輸署及九巴協調下，251C線獲提升至每天全日服務，並擴展為循環來往江夏圍至元朗(西)，不經錦河路及八鄉路(大欖隧道轉車站)，同時提高全程票價，而江夏圍往返大欖隧道轉車站之服務，則由錦上路「八鄉新馬路」巴士站提供的251A線替代，最終該項改動於2023年9月30日起實施。
行政長官於2022年發展的《施政報告》中，提出興建約30000個「簡約公屋」單位，而首兩批「簡約公屋」項目分別位於元朗修壆路及牛頭角彩興路。
為配合元朗修壆路的「簡約公屋」落成，運輸署與九巴於《2024-2025年度巴士路線計劃》中，建議開辦兩條巴士路線服務該區，其中一條為268線，來往修壆路簡約公屋至八鄉路(大欖隧道轉車站)，途經壆圍、沙埔村、爾巒、高埔村及錦上路站，方便沿線居民往返錦上路站接駁港鐵，或於大欖隧道轉車站轉乘其他巴士路線，該建議其後獲得元朗區議會通過，並於2025年3月28日起投入服務，同年4月25日延長服務時間至深夜，同年5月6日因應攸壆路簡約公屋(北)正式入伙，來回程繞經該處。
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